Ошибка "The given entity is not assigned to any store" появилась при попытке положить в корзину товар, который вместе с вариацией ранее был загружен из CSV через Feeds.
Для решения ошибки нужно добавить в соответствиях Feeds (в загрузчике товара) значение для "Stores", то есть указать, к какому магазину будут принадлежать товары.

Если на сайте один магазин, то при помощи модуля Feeds Tamper можно задать это единое значение (через ID магазина, по-умолчанию это 1).